
人間の住む物質界<アッシャー>と悪魔の住む虚無界<ゲヘナ>。本来は干渉することすらできない二つの次元だが、悪魔はあらゆる物質に憑依し、物質界に干渉していた。しかし人間の中には、そんな悪魔を祓う——祓魔師<エクソシスト>が存在していた。燐の父、藤本も優秀な祓魔師だったが、燐を狙ったサタンに憑依され、命を落としてしまう。サタンの血を引く燐は人類の脅威。死を要求される燐だったが、彼は父親と同じ祓魔師として戦う道を選ぶ——!
祓魔師たちは、受肉したサタンを崩壊させることに成功するも、地球そのものと融合をし始めたサタンの心臓は、それを核として巨大な城塞を建造。内部は迷路状となっており、さらにその入り口はイルミナティによって占拠。サタンの城塞迷路を攻略し、その心臓の破壊、もしくは封印をしなければ人類に明日は無い中、祓魔師たちは班分けをして城塞へ突入を開始する!
迷宮を突破した燐たちはサタンの心臓がある城塞の中心へ。サタンの心臓へ急ぐ燐たちだが、妨害者も次々現れる。サタンの心臓封印に欠かせないしえみを先に送り、燐と雪男は腐の王アスタロトと対峙…するも燐の心根を知ったアスタロトの改心により和解。遅れながらもサタンの心臓へ向かう。
一方で、サタンの心臓を守るため現れたルシフェルと、自身の存在証明のためにもルシフェル打倒を掲げるアーサー、そして万が一にもアーサーがルシフェルに体を乗っ取られる可能性を無視できないため、アーサーのルシフェル接近を止めようとするライトニング…三つ巴の戦いは、ライトニングがルシフェルを行動不能にした上で、アーサーに致命の一撃を与えるという結末で幕を下ろそうとしていた。
死を間際に迎えたアーサーを前に、ライトニングの脳裏には競争相手として、友として共に駆け抜けた日々がよみがえる。祓魔塾での運命的な出会い、聖騎士の地位を巡った因縁、そして結ばれた契約ーー。
アーサーが息を引き取るのを確認したライトニングだが、そこには違和感が。その時、拘束していたルシフェルの身体に異変が起きる。不意に警戒するライトニングを、突如息を吹き返したアーサーが蹴り飛ばす!
一度死んだことでライトニングを傷つけられない契約は無効化し、アーサーはライトニングに向け最大最強の奥義“エンジェリックエクスカリバー”を放って―――!?